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第三十章遗传和肿瘤网络思考下 (1/2)

36分子病,是发病机制的本征为分子水平的疾病,由于基因的表达问题(各种结构的突变和表达量和表达顺序)导致的异常,如结构和合成量,其本质是匹配问题。如镰形细胞贫血症就是由β珠蛋白第六位密码子由正常的谷氨酸gag变成疏水的缬氨酸gtg,形成hbs导致溶解度下降,不同层次的匹配使得网络的动力学性质是处于正常范围;疾病的出现是低概率的,但出现后我们可以寻找其后验概率(针对个体),即寻找可能的通路;发育的不同阶段,蛋白质的组合不同,其有规律地相互更替,其合成呈现严格的消长过程;合成降解速度,结构要整体匹配;代谢途径是网络的本征,其坍缩的结果可以视为不同的能级

37算命是概率网络坍缩的路径,由于相似性导致的共振,使得可以通过一定的本征推算出网络

38不同的药物可以扩散为不同的网络,其在机体的运算结果就是各种表现:机体结构和代谢过程(不同的系统);个体差异是选择性表达,最适作用浓度是机体的本征

39免疫的遗传是基因层次的表达,基因重排是序列匹配的变异,这是表观遗传的出路,使用免疫机制使得基因表达趋于正常从而治疗遗传病;多样性即组合的无限性,特定的组合是网络坍缩的结果,是有意义的生物途径。当表达的途径是错配时,重新激发整体的能量或许能够使得机体回复到有意义的低能状态;抗原抗体的相互作用是多通路,不同部位选择性表达的基因部位不同;特定基因携带者的患病几率不同,这是一种本征(如携带-dr4的人罹患类风湿关节炎的风险比正常人高6倍);组织相容性,即细胞的网络表达的耦合,这是高层次的匹配,其中抗原抗体的序列匹配是本征;可变区和固定区的耦合;断裂基因的表达模式,扩展到不同基因的组合层次,不同基因节段的联合表达;多层次的概率的路径组合,如2亿人类有糖尿病,xx人有xx症状如脚痛,其构建的网络可以分化为不同阶段的发展,利用群体的水平构建的概率网络来表达个体水平的问题,先升维再降维;

40智能化的结构:神经网络的层次网络,生物进化的遗传坍缩,都是基于1/0匹配

41基因突变或表达成基因突变是肿瘤的前提,任何组织都可以产生恶性肿瘤(或与干细胞相关,在迭代中不断筛选),这是网络的概率坍缩;染色体变异是基因自身的表达,一种染色体畸变与一种特异性肿瘤之间的恒定关系(概率的坍缩),是结果不是原因;检测基因与癌症的关系是整体和本征的关系,其相关度高,是中值定理和不动点原理的体现;基因的量子性质,其在染色体的线性排列,再进一步细化,每个基因可以分为一定的编码区和非编码区,这就提供了二次组合的机会,形成复杂网络;能引起宿主细胞恶性转化的基因,说明中心节点的作用是概率网络路径形成的关键;调控细胞生长的蛋白质,其功能或表达的改变可以自激活转变为癌基因,并诱导易感细胞出现肿瘤表型,其本质是概率的多重表达,其构成的网络根据分布函数的位置决定肿瘤表型,位置,程度;基因的激活是概率的突然改变如(碱基替换,缺失,插入;基因激活,基因融合;基因扩增);突变是持续的,选择是间断的,如同排尿,只有超过阈值才能表达,如二次突变和多重击中;表达异常是启动更高层次的网络机制,如山中伸弥的干细胞转导;多层次即多概率的组合路径,肿瘤的发生是发展的过程,是多函数的耦合;肿瘤内部也有不同派系的竞争,即异质性高,同时细胞内部也有一定的染色体竞争,在同一肿瘤内染色体数目波动的幅度较大。肿瘤的起源于同一祖细胞,这是变异的胜利者,即符合一定的本征;没有百分百的对应只有一定范围的概率对应,如慢性髓细胞性白血病(cml)患者中95%为ph阳性。多个癌相关基因的协同作用,要经过多阶段的演变,其中不同阶段涉及不同的癌相关基因的激活与失活。这是网络的最终表达的结果,起点和终点是确定的,路径是不确定的,只有坍缩后才能知道具体路径,可以确定的是起点和终点的连接

42系谱分析就是通过群体水平来初步确定个体的患病概率;诊断就是找到本征,寻找联系,相似性,印记,通过杂交寻找序列的匹配(dna序列,基因表达序列等等);pcr的爆炸性增长使得信息扩散成为网络,能够被观测;基因芯片的大规模的观测形成的网络根据不同标准可以分化为不同矩阵,其本征具有一定的生物意义;反义寡核苷酸技术是利用互补配对的原理使得表达沉默或增长;意义链和反义链rna共存抑制基因表达的效率达到单一意义链或反义链rna的10倍以上。反义技术封闭某些特定基因的表达,以达到抑制有害基因表达的目的。同义是否增强,不同的搭配可以使得网络整体的本征处于一定的正常范围

43一切治疗都是使得机体回复一定的周期,损有余补不足,达到网络的平衡;使用遗传算法寻找治疗:不同的方案有不同的适应度,寻找最优的组合解。适合度越高,形成概率越大,最后势必有一定的路径;结合免疫算法,匹配,不同程度的匹配;基因治疗,利用重组dna技术,将一定的序列(正常基因或互补序列)导入,从而对基因表达网络造成一定的影响,可以使得机体的网络恢复到


状态提示:第三十章遗传和肿瘤网络思考下
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